王占军^1* , 杨立伟^2* , 徐忠东¹ , 欧祖兰¹ , 袁华玲¹ , 任意飞¹ , 齐璐璐¹ , 何子昂¹ , 陈延松¹

1 合肥师范学院生命科学学院, 合肥, 230601;
2 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室, 南京, 210037;
*同行贡献作者
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 23 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001111
收稿日期: 2015年04月15日    接受日期: 2015年05月02日    发表日期: 2015年05月20日

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推荐引用：

Wang Z.J., Yang L.W., Xu Z.D., Ou Z.L., Yuan H.L., Ren Y.F., Qi L.L., He Z.A., and Chen Y.S., 2015, Identification and bioinformatics analysis of the PIN gene family in jatropha curcas, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding)，13(5): 1111-1122 (王占军，杨立伟，徐忠东，欧祖兰，袁华玲，任意飞，齐璐璐，何子昂，陈延松，2015，麻疯树PIN基因家族的鉴定与生物信息学分析，分子植物育种，13(5): 1111-1122）

PIN基因家族是一类调控植物生长素极性运输的重要载体元件。本研究利用功能已知的拟南芥PIN蛋白家族为参考序列，在麻疯树全基因组数据中共鉴定出9条PIN基因，并针对9条JcPIN基因开展系统的生物信息学研究，开展进化树构建和基序分析以及基因表达研究和密码子偏好性解析。结果发现：9条麻疯树PIN蛋白多属于由碱性氨基酸组成的稳定蛋白，均为位于细胞质膜上的非分泌蛋白；蛋白家族含有保守的N末端结构域，二级结构与拟南芥PIN蛋白相似；进化结果表明麻疯树PIN基因与毛果杨PIN基因家族关系最近；表达分析发现了4个可信度较高的麻疯树PIN基因，密码子偏好性分析确定了13个高频密码子，揭示了异源表达JcPIN时需要改造的密码子。研究结果可为将来开展麻疯树PIN基因家族的功能研究奠定重要基础，也为麻疯树其他基因家族和其他拥有大量数据的植物基因家族研究提供参考。

麻疯树；生长素；PIN基因家族；生物信息学